Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOX1O75936 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms