Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX3O75364 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX3O75364 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms