Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA4O75335 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms