Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms