Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMDSO60547 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMDSO60547 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMDSO60547 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMDSO60547 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMDSO60547 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMDSO60547 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMDSO60547 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GMDSO60547 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMDSO60547 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GMDSO60547 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GMDSO60547 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GMDSO60547 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GMDSO60547 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms