Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZIC3O60481 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC3O60481 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZIC3O60481 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms