Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATP10AO60312 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP10AO60312 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP10AO60312 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP10AO60312 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP10AO60312 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP10AO60312 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP10AO60312 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP10AO60312 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP10AO60312 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP10AO60312 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP10AO60312 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP10AO60312 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP10AO60312 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP10AO60312 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP10AO60312 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP10AO60312 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms