Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNQ3O43525 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNQ3O43525 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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