Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms