Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QR89 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QR89 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QR89 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QR89 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QR89 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QR89 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QR89 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QR89 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QR89 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QR89 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QR89 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QR89 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QR89 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QR89 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QR89 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QR89 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QR89 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QR89 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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