Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCER2I3L3R5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms