Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L11C9JVI0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms