Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVV-2B6SEH9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms