Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-1B6SEH8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms