Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DXG7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DXG7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DXG7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DXG7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DXG7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DXG7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DXG7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DXG7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DXG7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DXG7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DXG7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DXG7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DXG7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms