Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms