Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB19A4D1S5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms