Protein–RNA interactions for Protein: A0ZSE6

TMEM30CP, Cell cycle control protein 50C, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CPA0ZSE6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM30CPA0ZSE6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms