Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A0A0J9YXV3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms