Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 XRCC6P5-201ENST00000435236 1795 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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FOXC1Q12948 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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FOXC1Q12948 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 CCDC77-202ENST00000412006 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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FOXC1Q12948 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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FOXC1Q12948 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AL031594.1-201ENST00000417123 1932 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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FOXC1Q12948 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 TNFAIP8-204ENST00000503646 2502 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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FOXC1Q12948 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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FOXC1Q12948 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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