Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP6V1G1P3-201ENST00000442568 280 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 COX7CP1-201ENST00000446556 192 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC020978.1-201ENST00000465542 337 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL344P-201ENST00000485522 296 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL110P-201ENST00000498222 283 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC114300.1-201ENST00000502347 280 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC146949.1-201ENST00000505946 423 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC146944.1-201ENST00000508439 418 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GUSBP3-201ENST00000509348 423 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008667.1-201ENST00000515296 568 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC103855.2-202ENST00000527642 568 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PPCDC-210ENST00000568649 926 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4687-201ENST00000583618 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNRPCP20-201ENST00000588011 210 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR6124-201ENST00000617177 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC010507.2-201ENST00000632795 676 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DTHD1-201ENST00000357504 3203 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP5A1-202ENST00000398752 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DEPDC1-201ENST00000370966 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZBBX-203ENST00000392766 3250 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PROM1-207ENST00000508167 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRK2-202ENST00000343742 4740 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CLN8-212ENST00000637083 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF9-228ENST00000636926 5436 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 OR7E122P-202ENST00000641144 6171 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LOXHD1-207ENST00000441551 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC068473.3-202ENST00000589723 4167 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NR4A1-206ENST00000545748 3511 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RBM46-202ENST00000510397 3626 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC25A16-207ENST00000609923 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM238C-203ENST00000640121 3620 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ITGA11-202ENST00000423218 10192 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GLE1-202ENST00000372770 2218 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PTGER4-201ENST00000302472 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KDM2B-206ENST00000538046 2301 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TRPS1-209ENST00000519674 3116 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PTK2B-203ENST00000397501 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ORC1-202ENST00000371568 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GNAT1-201ENST00000232461 2417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC14-207ENST00000433542 3260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ABCC8-202ENST00000389817 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ACSBG1-214ENST00000560817 2462 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF200-204ENST00000414144 3306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PPFIA2-204ENST00000541017 4192 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TLDC1-201ENST00000343629 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CHTF8-201ENST00000306585 2561 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SSUH2-201ENST00000317371 2561 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.1 ms