Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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CUL1Q13616 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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CUL1Q13616 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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