Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 IREB2-208ENST00000560440 4396 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 CACNA1D-203ENST00000422281 6414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ADGRL3-213ENST00000509896 5069 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ELP2-203ENST00000358232 8459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 DDHD1-203ENST00000395606 12769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 FBN2-208ENST00000619499 10154 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 MCF2L2-203ENST00000447025 2394 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 CTC1-201ENST00000315684 7021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 LINC02210-213ENST00000591271 9678 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 SIM1-202ENST00000369208 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 FBXL20-201ENST00000264658 10388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 PIEZO2-210ENST00000580640 8334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 PRDM11-206ENST00000622142 10730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 OR7E122P-202ENST00000641144 6171 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 WDFY2-201ENST00000298125 9321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 BTAF1-201ENST00000265990 7250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ARHGEF11-202ENST00000368194 6889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 CD28-201ENST00000324106 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KRTAP21-2Q3LI59 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms