Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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