Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA3Q9Y6H8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms