Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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SNX13Q9Y5W8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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