Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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NFE2L3Q9Y4A8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFE2L3Q9Y4A8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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