Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HDGFL3Q9Y3E1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms