Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR3KQ9Y2Y1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms