Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms