Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHANK2Q9UPX8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms