Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms