Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF3Q9ULD4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms