Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms