Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms