Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms