Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC42EP3Q9UKI2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms