Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CROTQ9UKG9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms