Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIMS3Q9UJD0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms