Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms