Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP25Q9UHP3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms