Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2IRD1Q9UHL9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms