Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIP2Q9UDT6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLIP2Q9UDT6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms