Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLKQ9UBT6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms