Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL9Q9P2J3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms