Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP35Q9P2H5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms