Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms