Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms