Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms