Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZDHHC3Q9NYG2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms